Assistant ingénieur en biologie F/H

Employeur

L’Université de Bordeaux est une grande université dynamique, responsable, attentive au bien-être de ses personnels. La rejoindre, c’est travailler dans un cadre privilégié au sein d’une communauté professionnelle particulièrement diverse et ouverte, en bénéficiant de dispositifs d’accueil et d’inclusion, de formation et de mobilité interne. C’est participer à une aventure académique, scientifique et humaine. C’est s’engager à relever les défis du XXIe siècle.

Vous souhaitez travailler au service de la recherche sur une plateforme dotée d’outils innovants ?

Rejoignez l’unité TBM-Core – de l’Université de Bordeaux !

TBM-Core est une unité de service portée par l’Université de Bordeaux, le CNRS et l’INSERM. Elle regroupe depuis 2011 un ensemble de plateformes technologiques ouvertes à tous les laboratoires académiques Bordelais ou nationaux. Certains laboratoires privés bénéficient également de ses services.

La plateforme OncoProt, créée en 2017, est une plateforme d'analyse protéomique dédiée aux projets biologiques. Elle a pour expertise spécifique d'associer la microdissection laser et la spectrométrie de masse pour étudier le protéome de tous types de structures cellulaires ou tissulaires.

Dans le cadre du développement de la plateforme, nous recrutons un Assistant ingénieur en biologie F/H.

Votre mission

Votre mission sera d’adapter et de mettre en œuvre les approches méthodologiques de préparation des échantillons biologiques (cellules, sphéroïdes, tissus, fluides biologiques, sécrétomes, exosomes, éluats d’immunoprécipitations, etc…) pour permettre leur analyse protéomique par spectrométrie de masse dans le cadre de l’activité de service de la plateforme OncoProt.

Ces approches méthodologiques de préparation de tissus, isolation/collectes de structures ou de clusters cellulaires nécessitent l’utilisation de différents domaines d’activité de la plateforme (histologie, imagerie, microdissection laser), en collaboration avec les responsables de plateformes de TBMCore et de l’Institut Magendie et les utilisateurs de la plateforme.

Vous mettrez en œuvre les méthodes de déparaffinage, découpe laser, extraction protéique, réversion de fixation, dessalage et digestion trypsique des protéines. Pour chaque projet de recherche des utilisateurs, l’objectif sera d’optimiser l’identification et la quantification des protéines qui se fera ensuite par spectrométrie de masse. Vous utiliserez un robot d’ultrasonication focalisé (Covaris R320) et un robot pipeteur (Biomek I5) récemment acquis sur la plateforme et pour lequel vous devrez adapter les méthodes selon les projets des utilisateurs.

# Analyses et expérimentations

·       Vous participez aux échanges avec les utilisateurs de la plateforme sur les spécificités des échantillons tissulaires selon les objectifs de leur projet de recherche

·       Vous réalisez, en adaptant les conditions d’expérience, les techniques d'expérimentation pour la préparation d’échantillons biologiques pour l’analyse protéomique

·       Vous adaptez et mettez en œuvre les protocoles de préparation tissulaire, extraction protéiques et méthodes de commandes de robots adaptés à l’analyse protéomique par spectrométrie de masse

·       Vous prenez en main les robots de préparation des échantillons disponibles sur la plateforme OncoProt (Covaris R320 et BioMek i5), participez au suivi d’utilisation, d’entretien et de maintenance

·       Vous partagez vos connaissances aux utilisateurs sur les techniques de préparation des échantillons biologiques : méthodes d’extraction et de préparation des protéines, microdissection laser

# Vie du laboratoire

·       Vous animez des actions de formation sur l’analyse protéomique des supports biologiques dans le cadre de formations à des étudiants ou du personnel de recherche

·       Vous rédigez des rapports d'expériences ou d'études, des notes techniques

·       Vous participez à la démarche qualité ISO9001 et au suivi métrologique des équipements, et êtes garant de la bonne application des règles d'éthique, d'hygiène et de sécurité

·       Vous supervisez les plannings d’utilisation des ressources

Le + de ce poste : vous pratiquerez des techniques innovantes ! La microdissection permet d’isoler une région tissulaire d’intérêt grâce à une découpe laser, à partir de prélèvements fixés. Les protéines sont alors extraites après réversion de la fixation, elles sont ensuite digérées en peptides. Cette étape de préparation pré-analytique est réalisée de façon automatisée sur un automate (Biomek i5) permettant de limiter les contaminations et optimiser la robustesse de préparation des échantillons. Les peptides sont ensuite analysés par spectrométrie de masse haute résolution sur un appareil de dernière génération pour identifier et quantifier plusieurs milliers de protéines.

Vos atouts / Vos talents

Titulaire d’un diplôme de BTS ou DUT en biologie, vous avez une précédente expérience en histologie ou sur une plateforme d’analyse. 

·       Vous êtes organisé, rigoureux et avez le sens du service

·       Vous faites preuve d’appétence pour les projets pluridisciplinaires et savez travailler en équipe

·       Vous maîtrisez des techniques d’histologie : coupes, déparaffinage, coloration et d’analyses par imagerie

·       Vous parlez et comprenez l’anglais dans un contexte de travail multiculturel (niveau B2/C1)

Vous vous reconnaissez ? Postulez-vite !

Ce poste implique de travailler avec des échantillons biologiques humains fixés, divers solvants et CMR, et par conséquent de travailler en respectant les règles d’Hygiène et Sécurité relatives.

Plus d’informations :

En rejoignant la plateforme OncoProt de l’Unité Mixte de Service TBM-Core, vous travaillerez avec des outils de bioinformatique et de biologie intégrative dédiés et l’intervention d’un bioinformaticien de notre équipe, pour être support dans l’interprétation biologique des données de protéomique et dans la représentation graphique des résultats. Vous aurez de nombreux contacts avec les différents utilisateurs de la plateforme.

Retrouvez la vidéo de présentation ici !

Basé à Bordeaux - accès tram A (arrêt « Saint Augustin ») bus, vélo.

CDD de 13 mois

Salaire mensuel brut : 2130 €

Avantages liés au poste :

50 jours de congés annuels dès la première année

Prise en charge à 75% de l’abonnement aux transports en commun de Gironde

Participation à la mutuelle à hauteur de 15€ / mois

Restauration subventionnée

Des offres loisirs, sport et culture pour tous les personnels 

Forfait "mobilités durables" sur trajet domicile – travail

Parcours d’accueil et formations

Processus de recrutement : après la période de publication de l’annonce, nous prendrons contact avec les candidats retenus pour un entretien organisé avec le(s) manager(s) et le chargé de recrutement.

Conseil : votre lettre de motivation est lue et nous apporte des éléments complémentaires à votre CV !