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BOTS, d’innovation bleue à octobre rose

Mise à jour le :

À l'occasion du mois dédié au cancer du sein, zoom sur un projet européen original et innovant qui combine la création de nouveaux hydrogels marins avec la culture de mini-organes simplifiés (organoïdes) à partir de tumeurs, dans le but d'améliorer les traitements.

Photo : Pouvoir cultiver les cellules cancéreuses (en vert) est au cœur du projet BOTS © Gautier Dufau - université de Bordeaux
Pouvoir cultiver les cellules cancéreuses (en vert) est au cœur du projet BOTS © Gautier Dufau - université de Bordeaux

Qu’est-ce que le traitement du cancer du sein et les déchets de la pêche peuvent avoir en commun ? Le projet BOTS* - pour organoïdes bleus pour la sélection de traitement - porté par le professeur d’université Richard Iggo du centre de recherche Bordeaux Research of Oncology (BRIC – unité Inserm et université de Bordeaux).

Le cancer du sein touche une femme sur huit, et beaucoup d'entre elles en arrivent à un stade où elles ont besoin d'un traitement spécifique. Pour le trouver, il est nécessaire de tester la réaction des cellules cancéreuses de la patiente afin de déterminer quels médicaments seront les plus efficaces. C’est le projet de Richard Iggo, qui travaille sur le cancer du sein depuis de nombreuses années. Tout d’abord en Suisse, en Écosse et depuis 2008 à Bordeaux. À terme, il souhaiterait qu’une biopsie d’une patiente atteinte de cancer du sein permette de cultiver des cellules cancéreuses qui pourront ensuite être testées avec plusieurs traitements potentiels afin de trouver le plus efficace pour cette patiente. Il s’agit donc de thérapie personnalisée. Aujourd’hui, c’est faisable mais les cellules sont envoyées aux États-Unis, regrette le chercheur, à des coûts prohibitifs et ce n’est pas accessible à grande échelle

Conversion de produits maritimes en produits pharmaceutiques

Pour y parvenir, plusieurs éléments sont nécessaires. Tout d’abord, il faut pouvoir cultiver les cellules cancéreuses et c’est là l’originalité du projet financé dans le cadre du programme européen Interreg Espace Atlantique. Ce programme vise à promouvoir la coopération transnationale entre les pays riverains de l'océan Atlantique : la France, l'Espagne, le Portugal et l'Irlande, ainsi qu’à soutenir des initiatives pour la transition écologique.
Dans le cadre de BOTS seront ainsi créés des hydrogels à partir de la biomasse marine, à savoir des déchets jetés par les pêcheurs comme les écailles et arêtes de poissons, les carapaces de crustacés, des algues… Ces hydrogels - composé d’eau et de polymères - peuvent servir de support pour la culture cellulaire, car ils imitent les propriétés des tissus biologiques. Au sein du consortium créé pour ce projet, cette partie est gérée par l’Institut des sciences analytiques et de physico-chimie pour l'environnement et les matériaux (IPREM, unité CNRS et université de Pau et des Pays de l'Adour). Cependant cette matrice est toxique pour les cellules cancéreuses, c’est pour cela que les hydrogels doivent être, au préalable, « dérivatisés ». C’est la mission de l’équipe de Marie-Christine Durrieu, chimiste Inserm au sein de l’Institut de chimie et biologie des membranes et nano-objets (CBMN – unité Bordeaux INP, CNRS et université de Bordeaux). Les scientifiques apportent des modifications chimiques aux hydrogels pour modifier leurs propriétés, changer leurs propriétés adhésives et viscoélastiques afin de favoriser la survie et la prolifération des cellules tumorales.

 


En parallèle, des cellules avoisinantes sont ajoutées à des cellules tumorales pour que ces dernières puissent ensuite se développer voire proliférer comme si elles étaient dans le sein. Trois équipes de biologistes mammaires travaillent sur cette partie. En Espagne, au CIC bioGUNE, un organisme de recherche de Bilbao et au Royal College of Surgeons à Dublin en Irlande, les cellules testées sont des fibroblastes. Ce sont des cellules de soutien du tissu mammaire qui, dans certains cas, peuvent jouer un rôle dans le développement du cancer du sein.

A Bordeaux, Richard Iggo a choisi les cellules galactophores - qui forment et tapissent les canaux transportant le lait dans le sein. Le professeur d’origine anglaise est en effet convaincu depuis longtemps que ces cellules jouent un rôle important dans le développement des cellules cancéreuses. A terme et si les essais sont concluants, les deux types de cellules avoisinantes pourront être associés.

Richard Iggo est convaincu de l'implication des cellules galactophores dans le cancer du sein © Gautier Dufau - université de Bordeaux
Richard Iggo est convaincu de l'implication des cellules galactophores dans le cancer du sein © Gautier Dufau - université de Bordeaux

De la pêche à la recherche médicale : une innovation durable

Ensuite ces tumoroïdes de cancer du sein, créés à partir de cellules tumorales, seront incorporées dans les hydrogels et la phase de validation aura lieu à la faculté de médecine de l’université de Porto avec des anatomopathologistes chargés d'examiner les organoïdes. Ils doivent vérifier que les cellules tumorales se comportent de manière similaire aux tumeurs originales, afin d’assurer la fiabilité des tests de sensibilité aux traitements.
Pour réaliser ces tests, il est indispensable de disposer d’un grand nombre de cellules cultivées. « Mais il est difficile d'ensemencer manuellement de minuscules puits avec de minuscules quantités d'organoïdes dans de minuscules volumes d'hydrogel sans égarer les points, déposer des bulles ou faire durcir l'hydrogel avant que l'ensemencement ne soit terminé » explique le chercheur. Pour y parvenir, l’équipe de BOTS à Bordeaux, avec une postdoctorante Irinka Séraudie et une doctorante Gaïd Le Corre, va donc utiliser des bio-imprimantes 3D. Les hydrogels sont aussi adaptés par les chimistes afin de leur conférer des propriétés physiques nécessaires à la bio-impression.

« Notre objectif est de stimuler l'activité économique dans l'espace atlantique en créant des PME capables de créer les hydrogels nécessaires et de les utiliser pour tester des médicaments ici au lieu d'envoyer des échantillons cliniques aux États-Unis »

Richard Iggo, porteur du projet européen BOTS

Ce projet, initié par Richard Iggo avec l’aide du Service de montage et suivi de projet (SMSP) de l’université, permet donc de réunir un grand nombre d’experts dans des domaines très différents, en biologie marine, en chimie, en biophysique et en culture avec aussi l’objectif de développer des alternatives à l'expérimentation animale.
« Nous pourrons créer une filière complète qui fabrique des hydrogels à partir de bioressources maritimes, les dérivatiser pour fabriquer des produits de culture cellulaire en 3D de grande valeur et les utiliser pour sélectionner les traitements optimaux pour les patientes atteintes d'un cancer du sein » précise-t-il. Il prévoit également la création de PME qui fabriquent des hydrogels et fournissent des services de diagnostic basés sur ces derniers. « Notre objectif est de stimuler l'activité économique dans l'espace atlantique en créant des PME capables de créer les hydrogels nécessaires et de les utiliser pour tester des médicaments ici au lieu d'envoyer des échantillons cliniques aux États-Unis » conclut-il.

Pour en savoir plus

Lire l’article sur le site du département de recherche Sciences biologiques et médicales (SBM) de l’université et suivre le projet BOTS sur sa page Linkedin.

A droite, Martin Teichmann, responsable de l'équipe "Cibler la transcription dans le cancer du sein" de l'unité Bordeaux Research of Oncology (BRIC - unité Inserm et université de Bordeaux) avec l'équipe de BOTS : Gaïd Le Corre (doctorante), Irinka Saudie (post-doctorante), Salomé Huard (project manager) et Richard Iggo, porteur du projet.